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9癌種の細胞株から遺伝子変異の包括的リストを作成

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9癌種の細胞株から遺伝子変異の包括的リストを作成

米国国立がん研究所(NCI)ニュースノート

原文掲載日:2013年7月15日

 

NCIの研究者らは、NCI-60として知られている細胞株コレクションを構成する各種細胞ごとに、遺伝子変異の包括的リストを明らかにした。この新たなリストにより、癌研究、分子薬理学さらに創薬において最も頻繁に研究されているヒト腫瘍細胞株データがさらに厚みを増す。NCI-60癌細胞パネルは、異なる9種類の癌(乳癌、卵巣癌、前立腺癌、大腸癌、肺癌、腎臓癌、脳腫瘍、白血病、黒色腫)からなる。この研究において研究者らはNCI-60の各細胞株について、全エクソーム、すなわちDNAのコーディング領域の塩基配列を決定した。新たな癌変異や腫瘍細胞での異常な遺伝子発現パターンを明らかにし、これらの発現パターンや変異と癌が発生する過程で起こる事象との関連性を示すのが狙いだ。彼らはさらに、TP53BRAFおよびATAD5などの遺伝子の特定の変異と、ニュートリン(nutlin)、ベムラフェニブ(vemurafenib)、エルロチニブおよびブレオマイシンなどの抗癌剤活性との相関関係も見出した。

塩基配列を決定する大規模な研究を通じて新たな癌遺伝子が同定されるにつれ、このNCI-60の塩基配列データの結果が貴重な情報源となるとみられる。特定の遺伝子に変異を有する細胞株とそれらの遺伝子欠損を標的とする薬剤との60億を超える関連性を正確に示すためである。この新たなデータは、現在NCI-60に含まれており、CellMinerやIngenuityのウェブサイトなど多数の情報源を通じて、様々なフォーマットで自由に利用することができる。この研究結果は、がん研究センター(Center for Cancer Research)の遺伝学部門(Genetics Branch)長Paul S. Meltzer医学博士、および分子薬理学研究室(Laboratory of Molecular Pharmacology)長Yves Pommier医学博士、癌治療・診断部門ディレクターJames H. Doroshow医師の主導で行われ、2013年7月15日付Cancer Research誌電子版に掲載された。

原文
 

翻訳田村克代 

監修北丸綾子(分子生物学/理学博士)

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